该馆收藏有历史文物、革命文物和自然标本10万余件。其中一级品 443件，著名的有侯马东周盟书。侯马盟书主要记载晋国贵族赵孟在战胜政敌以后，为了巩固他的统治地位，利用盟誓来约束战败党羽的情况，对研究春秋晚期政治斗争、宗盟制度具有重要价值。新莽天凤元年(公元14)的平斛是除嘉量以外仅有的莽量标准器，容水19300毫升，比嘉量仅少容797.5毫升。重要藏品还有商代青铜龙纹觥、战国错金豆、汉代胡傅温酒樽、北宋开宝藏和福州鼓山大藏经、宋代抗金文献、元代王渊桃竹锦鸡图和明代水陆画等。